5 сентября 2016 года стало известно, что 28 августа 2016 года во Владивостоке прошел обыск в помещении Церкви Иисуса Христа святых последних дней (мормонов). Сотрудники полиции обнаружили и изъяли 3 компакт-диска с материалами якобы порнографического характера.
6 сентября 2016 года в Синодальном доме Российской православной автономной церкви (РПАЦ) в Суздале прошел обыск. В ходе обыска изъяты компьютеры. Два епископа задержаны.
5 сентября 2016 года сотрудники прокуратуры, МЧС и Роскомнадзора провели проверку мусульманского культурного центра «Созидание» в Симферополе. В ходе проверки была обнаружена запрещенная литература.
2 сентября 2016 года «Интерфакс» со ссылкой на пресс-службу Духовного управления мусульман сообщил о том, что в Тамбове старшеклассницу в белом мусульманском платке не пустили в здание школы № 13. 5 сентября 2016 года начальник управления образования Тамбовской области сообщила журналистам, что по обоюдному желанию родителей и администрации школы девочка переведена на домашнее обучение.
1 сентября 2016 года стало известно, что после протестов общественности администрация Братска отменила разрешение на строительство церкви евангельских христиан и реабилитационного центра в парке микрорайона «Южный Падун».
31 августа 2016 года Мировой судья судебного участка Сернурского судебного района Республики Марий Эл приговорил пастора Церкви христиан веры евангельской «Новое поколение» Александра Якимова к штрафу за "незаконное миссионерство".