18 октября 2024 года в Москве был задержан и затем арестован пастор церкви христиан веры евангельской «Церковь Святой Троицы» Николай Романюк. 24 октября пастор этой же церкви Роман Жуков подтвердил, что против Романюка возбуждено дело по ст. 280.4 УК из-за антивоенной проповеди 2022 года. 5 марта 2025 года Московский областной суд отклонил ходатайство об изменении Романюку меры пресечения на домашний арест. 7 июня суд вновь продлил срок содержания пастора под стражей.
30 мая 2025 года полицейские и ОМОН провели рейд в мусульманском молельном доме на Басовской улице в Москве. Силовики прибыли в помещение во время пятничной молитвы.
19 мая 2025 года стало известно о задержании в Москве организатора и участников центра развития личности «Свободная зона», предположительно распространявших саентологическую литературу.
24 апреля 2025 года представители православно-монархической организации «Двуглавый орел», созданной Константином Малофеевым, опубликовали петицию за запрет Украинской грекокатолической церкви как нежелательной организации.
В апреле 2025 года стало известно, что Министерство юстиции РФ вновь пытается лишить Российское библейское общество (РБО) статуса религиозной организации.
15 апреля 2025 года Савеловский районный суд Москвы оштрафовал двух иностранных граждан за «незаконное миссионерство».
31 января 2025 года Кузьминский районный суд Москвы оштрафовал Рузимухаммада Хасанжон Угли Косимова за «незаконное миссионерство» и выдворил его из страны.
9 января 2025 года было опубликовано заключение Московской государственной экспертизы на проект строительства мечети в Косино, вызвавший недовольство местных жителей. Эксперты дали отрицательное заключение.
Силовики провели рейды по выявлению нелегальных мигрантов в молельных домах Новой Москве и Реутове.
12 ноября 2024 года стало известно, что суды Москвы по иску прокуратуры изъяли у Свидетелей Иеговы трехэтажный дом в районе усадьбы «Михалково» и две квартиры и подвальное помещение недалеко от Сретенского бульвара, в Луковом переулке.