29 марта 2016 года в Набережных Челнах сотрудники полиции и ФСБ, выломав входную дверь, провели обыск в офисе Церкви саентологии на Набережночелнинском проспекте. Обыски прошли также в 10 квартирах последователей Рона Хаббарда.
В конце марта 2016 года в Ставрополе и в Прохладном (Кабардино-Балкария) сотрудники ФСБ и центра «Э» провели обыски в помещениях Свидетелей Иеговы. В ходе обысков была обнаружена литература из Федерального списка запрещенных материалов, которую, как считают верующие, им подбросили проверяющие.
11 марта 2016 года в Саранске сотрудники полиции проверили документы прихожан Центральной соборной мечети, часть верующих увезли в отделение. 14 марта 2016 года пресс-служба МВД по Республике Мордовии сообщила, что проверка документов проводилась «в целях выявления лиц, находящихся в федеральном розыске и предупреждения проявлений экстремизма».
11 февраля 2016 года сотрудники ФСБ в Крыму провели обыски в 11 домах крымских татар. Задержаны 12 человек, двоих из них отпустили. Обыски проходили в рамках расследования уголовного дела по ч. 1 и 2 ст. 205.5 УК (организация деятельности террористической организации), возбужденного в связи с деятельностью «Хизб ут-Тахрир» в Ялте и Алуште. 12 февраля 2016 года стало известно, что 8 из 12 мусульман отпустили. Однако обыски в Крыму продолжаются. В частности, обыск прошел в доме Эльдара Селямиева в селе Викторовка Бахчисарайского района, а также в селе Семенное Нижнегорского района - у родителей Вадима Сирука.
30 декабря 2015 года стало известно, что в Шахтах Ростовской области за проповедь на улицах города оштрафованы Свидетели Иеговы.