Конфликты с местным населением и организациями

13 декабря 2013 года в Москве муниципальный депутат Александра Андреева в своем блоге обратилась к жителям Лефортова с информацией о возможном строительстве храма на территории сквера за кинотеатром «Спутник». Она призывает местных жителей, уже выступавших против застройки сквера, начать сбор подписей против строительства храма.

В начале декабря 2013 года инициативная группа защитников Челябинского органного зала вновь обратилась к общественности. Начался сбор подписей под обращением к Владимиру Путину, Дмитрию Медведеву, Владимиру Мединскому, а также к предстоятелям Русской православной церкви, Католической церкви и Вселенскому патриарху с требованием остановить демонтаж органа, хранящегося в церковном здании, провести референдум и отменить решение о передаче здания епархии. Петицию подписали около 2 тысяч человек.

26 ноября 2013 года депутаты муниципального округа «Головинский» Северного административного округа Москвы отклонили согласование земельного участка под строительство храма на территории парка у Кронштадтского бульвара. 

1 декабря 2013 года в Санкт-Петербурге состоялась акция протеста против строительства церкви в сквере между Красноборским (быв. Церковным) переулком и 6-й Советской улицей (быв. Рождественской). На месте сквера раньше находилась церковь Рождества Христова на Песках. Местная администрация отказалась согласовать проведение акции, однако мероприятие состоялось. В нем приняли участие местные жители и коммунисты.