23 июня 2012 года стало известно, что в Отрадненском районе Краснодарского края в рамках уголовного дела, возбужденного по ч. 4 ст. 111 УК РФ, было проведено 23 обыска в жилых домах и три обыска на животноводческих фермах. В ходе обысков были изъяты религиозные материалы: три книги и 27 дисков, тетрадь с записями на арабском «с указанием сдачи денег на неустановленные объекты исламской пропаганды».
25 июня 2012 года стало известно, что неизвестные вырвали памятный крест на месте обнаружения останков детей Николая II Алексея и Марии в Поросенковом логу под Екатеринбургом. Хулиганы бросили вырванный крест поблизости.
20 июня 2012 года было опубликовано еще одно обращение к патриарху Кириллу в связи с ситуацией вокруг «Pussy Riot». Авторы этого текста отмежевываются от подписавших предыдущее письмо православных, призывавших патриарха ходатайствовать за участниц группы.
21 июня 2012 года «Интерфакс» в разделе «Аналитика» опубликовал статью Александра Щипкова «Про теракт и ультиматум патриарху», основная тема которой - письмо православных верующих патриарху Кириллу. По мнению православного публициста, авторы письма «заняли четкую идеологическую позицию», а само письмо представляет собой ультиматум патриарху.
В середине июня ученые-религиоведы, историки, журналисты в рамках круглого стола обсудили проблему современного российского антиклерикализма и его истоков. В дискуссии приняли участие Алексей Муравьев, Марианна Шахнович, Татьяна Чумакова, Виталий Найшуль, Леонид Блехер, Валентин Крапошин, Иван Битов.