7 июня 2025 года правозащитный центр «Сорок сороков» обратился в Следственный комитет с просьбой возбудить дело по ст. 148 (оскорбление чувств верующих) и ст. 282 УК (возбуждение ненависти) в отношении Апти Алаудинова, оскорбительно отозвавшемся о схиигумене Гаврииле (Виноградове), обвинившем мусульман в готовности «вырезать москвичей». Позднее православные активисты отказались от намерения добиваться возбуждения дела, решив, что «Апти Алаудинов не враг русским и православным, а друг».
16 июня 2025 года в Госдуму был внесен законопроект «О внесении изменений в статьи 12 и 16 Федерального закона "О свободе совести и о религиозных объединениях"». Законопроект запрещает проводить публичные богослужения, религиозные обряды и церемонии в жилых и нежилых помещениях многоквартирных домов.
2 июня 2025 года стало известно, что еще 29 апреля Генпрокуратура признала нежелательной деятельность Университета Бригама Янга (Brigham Young University) — расположенного в США исследовательского центра, основанного Церковью Иисуса Христа Святых последних дней (мормонов).
8 апреля 2025 года руководитель правового управления Московской патриархии игумения Ксения (Чернега), выступая в Госдуме на заседании межфракционной рабочей группы, предложила изменить законодательство, чтобы исключить изображение храмов без религиозной символики. 26 мая спикер Госдумы Вячеслав Володин объявил, что законопроект о защите религиозных символов «традиционных вероисповеданий будет внесен в Госдуму в ближайшее время.
1 мая 2025 года архиепископ Зеленоградский Савва (Тутунов), заместитель управляющего делами Московской патриархии, опубликовал в своем Telegram-канале объявление о сборе средств на покупку пяти дронов для нужд фронта. Сбор ведется на его личную банковскую карту.
24 апреля 2025 года представители православно-монархической организации «Двуглавый орел», созданной Константином Малофеевым, опубликовали петицию за запрет Украинской грекокатолической церкви как нежелательной организации.
23 апреля 2025 года глава Комитета Госдумы по развитию гражданского общества, вопросам общественных и религиозных организаций Яна Лантратова направила прокурору Московской области Сергею Забатурину обращение с просьбой провести проверку и дать правовую оценку деятельности организации «Мир всем» и признать ее деятельность нежелательной.
В апреле 2025 года стало известно, что Министерство юстиции РФ вновь пытается лишить Российское библейское общество (РБО) статуса религиозной организации.
16 апреля 2025 года Судебный департамент при Верховном суде РФ опубликовал статистические сведения о применении ст. 5.26 КоАП (нарушение законодательства о свободе совести, свободе вероисповедания и о религиозных объединениях) в 2024 году.