14 марта 2014 года стало известно, что члены Совета Федерации Артур Чилингаров и Вадим Тюльпанов обратились к российскому премьер-министру c заявлением в защиту Музея Арктики и Антарктики, расположенного в бывшем церковном здании.
21 февраля 2013 года Генеральная прокуратура вынесла представление
о нарушении законодательства министру культуры РФ. В ходе проведенной прокуратурой проверки было
обнаружены нарушения. В частности, было обнаружено, что в помещении церкви Архангела Михаила в
Андронниковом монастыре «проводятся бизнес-встречи и конференции».