23 ноября 2007 г. прокуратурой Северного округа Москвы возбуждено уголовное дело по ч. 2 ст. 282.2 УК РФ (участие в деятельности экстремистской организации) против сотрудницы газеты "Лимонка" Анны Комаровой. По мнению прокуратуры, А.Комарова участвовала в деятельности запрещенной Национал-большевистской партии (НБП) путем распространения и хранения печатной продукции.

За неделю до возбуждения дела в квартире А.Комаровой был произведен обыск, во время которого были изъяты старые архивные и новые номера газеты, финансовая документация, а также - адреса подписчиков и получателей "Лимонки". На основании изъятых материалов и было возбуждено дело.

По словам А.Комаровой, ее работа в газете "чисто техническая" - рассылка корреспонденции подписчикам и получателям газеты. "Считаю это дело чисто политическим. В моей деятельности ничего, представляющего опасность и угрозу обществу, нет. Это явное преследование по идеологическим мотивам", - заявила А.Комарова.

Известно, что по делу проходят еще два сотрудника газеты.