10 февраля 2004 г. Сергей Глазьев выступил на портале "Полит.Ру" с уточнением своих высказываний по поводу взрыва в московском метро. (6 февраля Сергей Глазьев заявил: :Чтобы пресечь угрозу терроризма, нужно пресечь финансовые корни терроризма, которые, как известно, тянутся из Москвы. Все знают об этих людях, которые работают на московских рынках, собирают с нас деньги, а потом платят их боевикам, чтоб они убивали наших людей. Поэтому душить терроризм нужно здесь;).

10 февраля С.Глазьев заявил: "Когда я говорил о корнях терроризма в Москве, я не имел в виду рыночных торговцев. Я говорил о теневых мафиозных структурах, контролирующих рынки в крупных городах. Терроризм спонсируется организованной преступностью, и чтобы его уничтожить, необходимо уничтожить каналы его финансирования" . Одновременно он отмежевался от националистических высказываний своего коллеги по блоку "Родина" Дмитрия Рогозина.