8 апреля 2013 года стало известно, что Томская митрополия претендует на комплекс зданий Министерства обороны. Министерство не использует несколько корпусов на улицах Никитина и Киевской, где до 1917 года располагались духовная семинария и епархиальное женское училище.

Переговоры о передаче этих зданий Церкви ведутся с 2010 года.

«Не пойти навстречу было бы неразумно, ведь здания погибают, их надо спасать, поэтому мы надеемся, что в ближайшее время какое-то решение будет принято», - заявил журналистам митрополит Томский и Асиновский Ростислав.

В случае передачи в этих зданиях планируется создать духовную академию.