В конце марта 2011 года стало известно, что 24 февраля в астраханскую мечеть им. Махмуда-Эфенди после ночной молитвы прибыли представители УФСБ, УФМС и полиции. Свой визит они объяснили поступившим к ним анонимным звонком об экстремистской деятельности в мечети. Они допросили преподавателей медресе и изъяли на экспертизу религиозную литературу. 25 февраля суд рассмотрел возбужденное против заместителя имама Хизри-хаджи Омарова дело об административном правонарушении и принял решение о депортации его в Азербайджан.
10 ноября 2010 года стало известно о том, что в Астрахани в начале октября 2010 года в одной из мечетей на подоконнике молельной комнаты были обнаружены листовки с текстом под названием “Обращения муджаидов к Астраханцам”. По данному факту 6 ноября 2010 года следственные органы УФСБ России по Астраханской области возбудили уголовное дело по ч.1 ст.280 УК РФ (публичные призывы к осуществлению экстремистской деятельности).