14 декабря 2012 года Общественная палата представила ежегодный доклад о состоянии гражданского общества в 2012 году.

По словам члена Общественной палаты Иосифа Дискина, в результате обсуждения некоторые положения доклада в разделе, посвященном свободе совести, изменились. Были сняты «высказывания о том, что Церковь огосударствляется», «утверждения о падении доверия народа к Церкви в связи с позицией по поводу акции "Pussy Riot"», а также «утверждения о том, что население страны боится превращения Церкви в государственно-идеологический департамент». С критикой этих положений доклада выступили члены Общественной палаты прот. Всеволод Чаплин, епископ Сергей Ряховский и политолог Максим Григорьев.

Николай Сванидзе в своем комментарии к докладу указал, что «в последний год изменилась позиция государства в отношении так называемых традиционных для России конфессий и конфессий, не являющихся таковыми». По его мнению, неопределенность в решении межнациональных и межрелигиозных вопросов может «привести к непредсказуемым последствиям».

Окончательный вариант доклада будет издан в начале 2013 года.