Глава юридической службы Московской патриархии игумения Ксения (Чернега) полагает, что миссионерская деятельность в этом законопроекте трактуется «очень широко», поскольку «к ней, фактически, отнесены все виды религиозной деятельности», т. е. православные не смогут свободно проводит крестные ходы, распространять православную литературу в магазинах и киосках и проповедовать в СМИ.

«Надеемся, что все эти нормы будут применяться в отношении нетрадиционных религиозных организаций сектантской направленности. Но если они будут применяться в отношении религиозных организаций Русской православной церкви, то, безусловно, мы будем ставить вопрос о корректировке этого законопроекта», - заявила игумения.

По мнению первого заместителя председателя Совета муфтиев России (СМР) Рушана Аббясова, в случае принятия этих поправок «опять будут страдать сами религиозные организации, но не борьба с экстремизмом и терроризмом, как было заявлено».

Для борьбы с терроризмом, считает он, нужно «находить какое-то решение, которое, с одной стороны, не затрагивало бы права верующих людей, – то есть, наших религиозных организаций – но и, с другой стороны, мы бы сообща думали о том, как бороться с этим явлением, которое угрожает всему миру».

Президент Федерации еврейских общин России (ФЕОР) раввин Александр Борода уверен, что поправки противоречат закрепленному в Конституции РФ принципу свободы вероисповедания. «Огромным минусом» законопроекта он считает то, что «законодатель не указал точного критерия разграничений религиозной и миссионерской деятельности, поэтому закон можно "извращать", как захочется, и могут применяться, соответственно, формулировки выгодные в конкретной ситуации».