15 августа 2013 года стало известно, что в Тюмени возбуждено уголовное дело по факту гибели игумена Макария (Лошкарева). Дело возбуждено по ст. 111 УК РФ (Умышленное причинение тяжкого вреда здоровью), рассматривается вопрос о переквалификации на более тяжкую статью.
По данным следствия, убийство произошло на бытовой почве: священника избил друг во время ссоры. Сам подозреваемый заявил, что защищал себя.